順式作用元件是同一DNA分子中具有特殊功能的轉錄因子DNA結合位點和其它調控基序，在基因轉錄起始調控中起重要作用;按功能特性分為通用調節元件如啟動子、增強子及沉默子和專一性元件如激素反應元件，cAMP反應元件; 確定順式作用元件的試驗方法主要有:DNA結構分析、序列分析和基因刪除或替換等，軟件預測是確定順式作用元件的另一種方法，但不同軟件預測結果差異較大，將試驗方法與軟件預測相結合能夠提高順式作用元件預測的準確性。

多細胞有機體在生長、分化和發育過程中需要整合不同組織的、發育的、環境的信號調節基因表達，轉錄起始的調節是其中的重要一環。順式作用(cisacting)元件是同一DNA分子中具有轉錄調節功能的特異DNA序列，即具有特殊功能的轉錄因子DNA結合位點和其他調控基序(motif)。

順式作用元件是指與結構基因串聯的特定DNA序列，是轉錄因子的結合位點，它們通過與轉錄因子結合而調控基因轉錄的精確起始和轉錄效率。

順式作用元 件在分子遺傳學領域，相對同一染色體或DNA分子而言為"順式"(cis);對不同染色體或DNA分子而言為"反式"(trans)。

順式作用元件是轉錄調節因子的結合位點，包括啟動子、增強子和沉默子。真核基因啟動子是原核啟動序列的同義語。真核啟動子是指RNA聚合酶及轉錄起始點周圍的一組轉錄控制組件，每個啟動子包括至少一個轉錄起始點以及一個以上的功能組件，轉錄調節因子即通過這些機能組件對轉錄起始發揮作用。在這些調節組件中最具典型意義的就是TATA盒子，它的共有序列是TATAAA。TATA盒子通常位于轉錄起始點上游-25至-30區域，控制轉錄的準確性和頻率。TATA盒子是基本轉錄因子TFⅡD結合位點;TFⅡD則是RNA聚合酶結合DNA必不可少的。除TATA盒子外，GC盒子(GGGCGG)和CAAT盒子(GCCAAT)也是很多基因中常見的，它們位于起始點上游-30至-110bp區域。 所謂增強子就是遠離轉錄起始點、決定組織特異性表達、增強啟動子轉錄活性的特異DNA序列，其發揮作用的方式與方向、距離無關。增強子與啟動子非常相似:都是由若干組件組成，有些組件既可在增強子、又可在啟動子出現。從功能方面講，沒有增強子存在，啟動子通常不能表現活性;沒有啟動子，增強子也無法發揮作用。增強子和啟動子有時分隔很遠，有時連續或交錯覆蓋。

某些基因有負性調節元件棗抑制子(沉默子)存在。有些DNA序列既可作為正性、又可作為負性調節元件發揮順式調節作用，這取決于不同類型細胞中DNA結合因子的性質。