海馬結構呈前后走向，占據顳葉的內下部，突出于側腦室顳角底部側副裂內側。海馬結構的命名和區分尚未統一。通常將其由外向內(或由下而上)劃分為海馬旁回、下托、海馬溝、齒狀回(海馬角)、室床和海馬傘等。海馬由向內卷曲的數個小的腦回覆蓋海馬溝而成，因外觀似海馬而得名，而打開側腦室顳角所見到的海馬看上去則更像蠶蛹或羊角，故又稱其為海馬角；海馬長約5cm，前部為稍彎向內側的海馬腳，與騎跨在側腦室顳角尖部的杏仁核簇相接。室床是鋪展在海馬腦室面的閃光白質層，這層白質向后延伸形成海馬傘，后者進一步向后內上伸展形成穹隆。

1、灰被：

灰被又被稱為胼胝體上回，是胼胝體背面的薄層灰質，向兩側進入胼胝體溝，在溝底移行于扣帶回皮質。它向前繞過胼胝體膝，移行于兩側的胼胝體下回；向后繞過胼胝體壓部，移行于兩側的束狀回。束狀回是一條灰質，向前、下、外移行于齒狀回和海馬。在每側胼胝體上回內有兩條縱行纖維束，靠正中線的一條叫內側縱紋，外側的一條叫外側縱紋。縱紋的纖維向前聯絡胼胝體下回，向后經束狀回到海馬傘。胼胝體纖維可能穿胼胝體，進入穹隆。

2、齒狀回：

齒狀回是一窄條灰質，除內側面外皆被海馬包繞，其內側游離面有橫溝分隔成齒狀，故名齒狀回。后端與海馬傘分離，移行于束狀回。其前端到海馬回溝的凹口處，呈銳角彎向內，橫過海馬回溝的下面，稱此橫帶為齒狀回尾。此橫帶把海馬回溝分為前后兩部，前部叫溝回，后部叫內邊緣回。

3、海馬：

海馬是側腦室下腳底壁一個弓形隆起，其前端較寬，有淺溝分隔成2～3個隆起，呈爪狀，稱為海馬足。海馬的后端移行于束狀回，海馬表面蓋有腦室膜，膜的深面是一層白質，成為室床。其纖維向海馬內側緣集聚，形成縱行的纖維束，稱為海馬傘。海馬傘向后移行于穹隆。

4、下托：

下托是海馬回皮質和海馬皮質間的過渡皮質，從海馬旁回皮質的六層到海馬皮質的三層間，下托區皮質由五層逐漸變為4層，隨之各部的聯系也有差異。因此，常把下托分為4個帶形區：即旁下托、前下托、下托和下托尖。一般把前兩帶形區歸入內嗅區，后兩帶形區歸入海馬。

海馬結構包括海馬及其附近的齒狀回、束狀回、胼胝體上回、海馬回鉤和下腳在內的完整結構和功能體。與學習、記憶、注意、情緒、感知覺信息的處理及運動功能有密切關系。

海馬有一個很低的癲癇發作閾。發源于嗅腦某一部分的發作性發放，迅速擴散到嗅腦的其他區域和丘腦下部，或者成為彌漫性的。在海馬以及顳葉近中線部分內，鄰近海馬的結構硬化是在尸體解剖時于癲癇患者腦內最常見的病理改變，因而認為顳葉近中線部硬化是兒童期出現癲癇發作最常見的原因。在海馬癲癇發作時，可出現各種精神運動性效應，包括嗅覺、視覺、觸覺和其他類型的幻覺，即使患者失去知覺，知道這是虛幻，也不能抑制。